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主要区别：第一，属性不同，短尾蝮蛇是蝰科亚洲蝮蛇属而五步蛇是蝰蛇科尖吻蝮属。第二，大小不同，短尾蝮体形短小，而五步蛇长而粗第三，毒性不同，短尾蝮毒性略低，而五步蛇毒性略强。

短尾蝮蛇背面浅褐色到红褐色，有两行深棕色圆斑，左右交错或并列，圆斑中央色浅，外侧常开放呈马啼形，有的标本还有一条红棕色脊线眼后有一呈色眉纹，其上缘镶以黄白色边尾后段黄白色，但尾尖常为黑色。吻棱明显鼻间鳞外侧尖细笛向后弯背鳞中段21行。

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